Søren Johannsen er uddannet orkesterdirigent hos Frans Rasmussen og Michel Tabachnik med eksamen fra dirigentklassen på Det Kgl. Danske Musikkonservatorium i 2001.

Han har haft dirigentopgaver i Danmark, Polen, Rumænien, Letland, Bulgarien, Italien og Frankrig.

Han er medstifter og fast dirigent for Københavns Festivalorkester.

Søren Johannsen tog organisteksamen i 1992 fra Det Kgl. Danske Musikkonservatorium. Året efter blev han optaget i solistklassen og havde sin debutkoncert i Helligåndskirken, København i 1995.

Med det klassiske orgelrepertoire har Søren Johannsen givet en række koncerter i Danmark og i udlandet.

I 2007 blev Søren Johannsen ansat som organist i Christians Kirke i København.